Chỉ đạo gửi Cục Hàng không trong tối 25/3, Bộ Giao thông Vận tải cho biết các khu cách ly tại khu vực Hà Nội đã quá tải, không còn khả năng tiếp nhận thêm. Cục Hàng không cần thông báo ngay đến các hãng hàng không về việc dừng vận chuyển hành khách là công dân Việt Nam trên các chuyến bay quốc tế về sân bay Nội Bài. Các chuyến bay sẽ hạ cánh xuống sân bay Vân Đồn (Quảng Ninh).
Ngày 25/3, sân bay Nội Bài đón trên 500 hành khách quốc tịch Việt Nam từ 4 chuyến bay từ Nga, Nhật Bản, Thái Lan. 165 khách trên chuyến bay của Vietnam Airlines từ Đức đã chuyển hướng hạ cánh tại sân bay Vân Đồn. Toàn bộ hành khách sau khi nhập cảnh được cách ly tập trung 14 ngày.
Cùng ngày, các hãng hàng không trong nước đã dừng bay các chặng quốc tế, chỉ một số ít chuyến bay có thể bổ sung theo thực tiễn. Một số hãng hàng không nước ngoài vẫn vận chuyển hành khách người Việt đến Việt Nam.
Ngày 23/3, Bộ Giao thông Vận tải cũng đã yêu cầu tạm dừng vận chuyển công dân Việt Nam từ nước ngoài tới sân bay Tân Sơn Nhất cũng với lý do các khu cách ly không thể tiếp nhận thêm người. Các chuyến bay được chuyển hướng về sân bay Cần Thơ.
Trước đó, Chính phủ yêu cầu Bộ Giao thông vận tải có biện pháp hạn chế và giãn cách các chuyến bay vận chuyển hành khách từ nước ngoài vào Việt Nam, hạn chế hạ cánh tại sân bay Nội Bài, Tân Sơn Nhất.
